洁净厂房按规范要求，设置了自动报警系统、自动灭火系统、室内消火栓给水系统和防排烟系统等。
（一）自动灭火系统。洁净厂房一般根据部位保护的需要，设有二氧化碳、泡沫、喷水等自动灭火器系统。特别是部分精密昂贵的仪器还自带有自动气体灭火装置，当本设备发生火灾时，能实施自救。
（二）室内消火栓给水系统。厂房内设有室内消火栓给水系统，在洁净室的参观通道、安全疏散出口等处，都设有墙式消火栓，能满足初起火灾扑救的用水需要，而且室外还设有水泵接合器，必要时利用消防车向室内管网***。
（三）消防专用通道：为了方便人员逃生和确保消防人员能迅速进入洁净室灭火，洁净室内都设有专用的消防通道和出入口，并能连接逃生平台。
（四）防排烟系统：由于洁净厂房高大密闭，单独设置排烟设施难度较大，因此其排烟设施都与净化空调系统合用，并设有自动关闭的防火设施。
（五）洁净厂房因为生产工艺对建筑物的特殊要求，防火设计上也有自己的特点。1、厂房主体多为钢筋混凝土结构，或者轻钢结构，厂房多分隔为若干小间；2、在生产过程中使用了甲醇、丙酮、甲苯等毒害品、惰性气体、腐蚀性物品和易燃易爆化学危险物品，对洁净厂房构成了潜在的火灾隐患；3、常处于密闭状态，少窗少门；4、厂房内设备昂贵，怕高温、忌水；5、厂内工作人员少，不利于发现火情和处理初期火灾；
